Στόχος του έργου είναι η ανάπτυξη αντιμικροβιακών φαρμάκων, δηλαδή μικρών μορίων που δρουν κατασταλτικά ενάντια συγκεκριμένων ενζύμων-πρωτεϊνών που μελετούνται. Από τεχνικής άποψης, θα αναπτυχθεί ένα σύστημα που θα έχει σαν μόνιμη είσοδο μερικές εκατοντάδες χιλιάδες γνωστά μόρια (σε ηλεκτρονικό format σχετικά με την 3D αναπαράσταση της δομής τους στο χώρο) από τη βάση δεδομένων του Cambridge Crystallographic Data Centre (CCDC). Το σύστημα θα παίρνει σαν είσοδο ένα συγκεκριμένο ένζυμο-πρωτεϊνη (ιογενής) προς εξέταση από τις βάσεις δεδομένων του RCSB Protein Data Bank. Αφού ανιχνευτεί ο συνδυασμός των ατόμων που επιδρούν κατασταλτικά στα ιογενή αυτά μόρια, στόχος είναι να βρεθεί ένας πανομοιότυπος τέτοιος συνδυασμός ατόμων στα υποψήφια μόρια από το CCDC. Τέλος, θα κατασκευαστεί ένας πίνακας με τις αποστάσεις των δομικών στοιχείων του συνδυασμού αυτού από τα υπόλοιπα δομικά στοιχεία του προς εξέταση ενζύμου, για να διαπιστώσουμε αν παρεμβάλλεται σε αυτά. Έτσι, θα διαπιστωθεί ποιά από τα υποψήφια μόρια της CCDC έχουν μικρότερη παρεμβολή και άρα μπορούν να αποτελέσουν το φάρμακο.

• Φορέας Χρηματοδότησης: ΓΓΕΤ

• Συνεργαζόμενοι Φορείς: Virtual Trip Ε.Π.Ε., Πανεπιστήμιο Κρήτης (Εργαστήριο Ενζ. Τεχνολογίας, Εργαστήριο Βιοτεχνολογίας Φυτών, Εργαστήριο Κρυσταλλογραφίας)

• Έναρξη - Λήξη: 19/6/2006 - 31/3/2008 (Διάρκεια: 24 μήνες)

• Project Budget: 400.000,00 €

• Project Funding: 240.000,00 €

• VTrip Budget: 230.000,00 €

• VTrip Funding: 70.000,00 €